血清类风湿因子是变性IgG的抗体，凡能产生变性IgG的疾病均有可能产生抗变性IgG的抗体-类风湿因子，所以，类风湿因子并不是类风湿性关节炎所特有的。如某些细菌、病毒感染的疾病、变态反应性疾病、自身免疫性疾病等，类风湿因子也可以阳性，尤其是系统性硬皮病、系统性红斑狼疮等风湿病常可检测到类风湿因子，甚至大约有5%左右的正常人类风湿因子为阳性。由此证明，类风湿因子阳性并不能确诊为类风湿性关节炎，必须结合病史、临床表现和其它检查结果，全面分析，才能作出正确的判断。
同样，类风湿因子阴性也不能完全排除类风关。因为类风关患者类风湿因子阳性率大约在80%左右，有20%左右的患者为阴性。所以，类风湿因子阴性并不能完全否定类风湿性关节炎。其次，类风湿因子可以是IgM型类风湿因子，也可以是IgG型类风湿因子或IgA型类风湿因子。而现在通用的方法只能检出IgM型类风湿因子，不能测到IgG型类风湿因子或IgA型类风湿因子。所以，即使是IgM型类风湿因子阴性，也不能完全排除类风湿性关节炎。